Resident Evil: The Mercenaries 3D presenta un desarrollo totalmente enfocado a la acción en el que los jugadores compiten contra el reloj para abatir al mayor número de enemigos posibles en un período de tiempo prefijado. El juego cuenta con las misiones del modo Mercenarios extraídas de Resident Evil 4 y Resident Evil 5, completamente realizadas en gráficos 3D para la nueva portátil de Nintendo.