El simpático champiñón Captain Toad, protagoniza este videojuego que mezcla rompecabezas y plataformas basada en las mini-pruebas mostradas en Super Mario 3D World. Los jugadores de Captain Toad: Treasure Tracker han de usar la consola para investigar cada nivel de todos todos los ángulos y guiar al protagonista hacia el final sin ningún poder especial ni ayuda adicional.